| 更新時間： | 2025-02-18 |
| 訪問量： | 1842 |
| 廠商性質： | 生產廠家 |
提供商: 上海研謹生物服務名稱: 環狀RNA芯片定製檢測服務交付標準規格: 實驗服務價(jia) 格： 1000元收費標準/服務周期/提供結果:歡迎谘詢詳談，我們(men) 會(hui) 根據您的方案及需求製定詳細的服務協議。更多實驗技術服務請瀏覽網站其他內(nei) 容,或來電詳詢!
環狀RNA芯片定製檢測服務
實驗技術簡介: 環狀RNA (ircRNA) 是區別於(yu) 傳(chuan) 統線性RNA的一類新型RNA,具有閉合環狀結構,大量存在於(yu) 真核轉錄組中。大部分的環狀RNA是由外顯子序列構成，在不同的物種中具有保守性,同時存在組織及不同發育階段的表達特異性。由於(yu) 環狀RNA對核酸酶不敏感，所以比線性RNA更為(wei) 穩定， 這使得環狀RNA在作為(wei) 新型診斷標記物的開發應用上具有明顯優(you) 勢。近來研究顯示，環狀RNA在不同物種中起到miRNA海綿的作用,稱之為(wei) 競爭(zheng) 性內(nei) 源RNA (ceRNA) ， 能競爭(zheng) 性結合miRNA。而與(yu) 疾病關(guan) 聯性miRNA的相互作用說明環狀RNA對疾病的調控起著非常重要的作用。
實驗操作流程:
1、樣品RNA抽提
2、RNA質量檢測
①使用Nanodrop測定RNA在分光光度計260nm、280nm和230nm的吸收值，以計算濃度並評估純度。
②用甲醛電泳試劑進行變性瓊脂糖凝膠電泳，檢測RNA純度及完整性。
③提供RNA QC報告。
3、RNase R處理
4、cDNA/aRNA樣品合成和標記
5、標記效率質量檢測使用Nanodrop檢測熒光標記效率，標記效率合格以保證後續芯片實驗結果的可靠性。
6、芯片雜交
在標準條件下將標記好的探針和高密度基因組芯片進行雜交。
7、圖像采集和數據分析
使用GenePix 4000B芯月掃描儀(yi) 掃描芯片的熒光強度,並將實驗結果轉換成數字型數據保存，使用配套軟件對原始數據進行分析運算。
8、提供實驗報告
①Scanning Image: Cy3熒光掃描圖像;
②Scatter Plot:散點圖，X軸為(wei) Control信號值，Y軸為(wei) Experiment信號值， 表示信號數據總體(ti) 分布趨勢;
③Raw Data:探針的掃描熒光信號強度原始數據;
④Normalized Data:經過統計學方法標準化後數值;
⑤P-value: T-test統計分析顯著差異表達的基因，p-value越小， 該circRNA在兩(liang) 組樣本間差異表達越顯著
⑥significant Up & Down Regulated CircRNA List:顯著差異表達的circRNA列表包含Fold Change, p-valuel以及circRNA的詳細注釋信息(相應的線性mRNA和miRNA結合位點)。
客戶提供:
1、實驗對象為(wei) 組織樣品，取適量(50-100mg) 新鮮組織樣品或正確保存的組織樣品，使用
BioPulverizer TM冰凍粉碎組織，加1m的RNA抽提試劑TRIzol (Invitrogen) ，使用Mini-Bead-Beater-16勻漿後抽提RNA。
2、實驗對象為(wei) 細胞樣品，每份樣品取1x106~ 1x107細胞，加1m的RNA抽提試劑TRIzol (樣品為(wei) 貼壁細胞，每10cm2培養(yang) 皿TRIzo1使用量為(wei) 1ml)，裂解後抽提RNA。
交付標準:
1、芯片檢測數據
2、完整的實驗操作規程、實驗報告(含軟件分析結果)以及實驗材料
實驗代做服務：
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