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羊痘病毒(GaPV)核酸檢測試劑(熒光PCR法,外源內標)
點擊次數:623 更新時間:2024-08-07

羊痘病毒(GaPV)核酸檢測試劑(熒光PCR法,外源內(nei) 標


 

包裝規格:48 T/

產(chan) 品說明:

采用Taqman探針技術,以羊痘病毒(GaPV,羊痘病毒屬包含綿羊痘病毒、山羊痘病毒和牛結節性皮膚病病毒等3種病毒)特異性保守基因為(wei) 靶位點設計特異性引物和探針,用於(yu) 樣品中GaPV核酸的輔助檢測。本產(chan) 品引入了dUTP / UDG 係統,可降解含UssDNAdsDNA,消除由PCR產(chan) 物導致的交叉汙染。 同時設置陽性內(nei) 對照 (即內(nei) 標,使用VIC報告基團),通過檢測內(nei) 標是否正常來監測qPCR體(ti) 係中是否含有 PCR抑製物,避免出現假陰性結果。

產(chan) 品組成:


組分名稱

主要成分

DV231Y-21-V1

1

GaPV PreMix-2

qPCR反應緩衝(chong) 液、dNTPsUDG酶、Taq酶、引物、探針

960  μL/

2

GaPV陰性對照-2

無酶水

400  μL/

3

GaPV內(nei) 標對照-2

含內(nei) 標擴增片段的核酸

480  μL/

4

GaPV陽性對照-2

含目標擴增片段的核酸

50  μL/

注:不同批號產(chan) 品的成分之間不可以混用或互換!!!

儲(chu) 存條件和保質期:

-20±5避光儲(chu) 存,有效期12月。幹冰運輸。重複凍融小於(yu) 5次。生產(chan) 日期,失效日期請見外包裝盒。

適用儀(yi) 器:

ABI7500宏石96PBio-Rad CFX96實時熒光PCR儀(yi) 等。

樣品要求:

1、適用樣品類型

活體(ti) 或剖檢牛羊的皮膚丘疹、肺部病變組織、淋巴結、血液等樣品

要求送檢新鮮樣品,禁止反複凍融!

2、樣品處理(核酸提取區)

參照NY/T 541-2016 獸(shou) 醫診斷樣品采集、保存與(yu) 運輸技術規範》等標準進行樣品前處理, 使用商業(ye) 化的提取試劑盒提取樣品中的核酸。提取時,每200 μL陰性對照處理後的樣品溶液中添加10 μL內(nei) 標對照,提取後的核酸應立即檢測,否則凍存於(yu) -20±5,保存時間不超過6個(ge) 月,禁止反複凍融

*內(nei) 標對照的其它使用方:將內(nei) 標對照混入 qPCR工作液中,但僅(jin) 僅(jin) 質控擴增過程和監測qPCR體(ti) 係中是否含有 PCR抑製物,不能質控提取核酸過程

檢測方法

為(wei) 了防止汙染,實驗需分區操作!!!

注:核酸提取參照樣品要求,在核酸提取區進行或在樣品處理區進行。

1、試劑準備 (在試劑準備區進行)

(1) 推薦方式(內(nei) 標對照質控核酸提取和核酸擴增過程)

取出試劑盒中的各組分以及自備試劑,室溫放置,待溫度平衡至室溫,混勻後備用;

根據檢測樣品數量,建議每次檢測均設置陰性對照和陽性對照。將所需數量(N)的GaPV PreMix-2分配到每個(ge) 微離心管(如八連管)中,20 μL/管。待檢樣品數為(wei) n時,所需反應數N=樣品數(n)+陽性對照(1)+陰性對照(1)

當準備使用時,再轉移到樣品處理區。

(2) 其它方式內(nei) 標對照僅(jin) 質控核酸擴增過程

根據所檢測的樣品數量按照下表配製反應液,建議每次檢測均設置陰性對照和陽性對照。待檢樣品數為(wei) n時, 需配製反應體(ti) 係數N=待檢樣品數(n) +陽性對照(1)+陰性對照(1)+1

*qPCR工作液配製表(其它方式)

組份

每反應體(ti) 積(μL)

GaPV PreMix-2

20 μL×N

GaPV內(nei) 標對照-2

0.5 μL×N

*注:本配製方法為(wei) 在提取樣品核酸未加內(nei) 標對照時的補救方法,不推薦。

將配製好的qPCR工作液充分混勻後瞬時離心,待用;當準備使用時,將等量的20 μL分配到每個(ge) 微離心管(如八連管)中,並轉移到樣品處理區。

2、樣品加樣 (在樣品處理區進行)

 在每個(ge) PCR管中加入5 μL經提取的待測樣品和陰性對照、陽性對照,蓋上管蓋, 瞬時離心,使液體(ti) 全部沉於(yu) 管底。

3qPCR擴增 (在擴增與(yu) 分析區進行)

 (1) 熒光通道選擇

熒光基團選擇FAM通道檢測GaPV;選擇VIC 通道檢測內(nei) 標;淬滅基團設置為(wei) none。如ABI qPCR儀(yi) ,還需設置Passive Reference為(wei) none。其它儀(yi) 器參考儀(yi) 器說明書(shu) 。

(2) qPCR擴增程序設置

設置反應體(ti) 係為(wei) 25 μL

 

步驟

溫度

反應時間

循環

UDG消化

50

5 min

1

預變性

95

30 sec

1

擴增

變性

95

5 sec

45

退火與(yu) 延伸

60

35 sec,數據收集

4、結果分析 (ABI7500 qPCR儀(yi) 為(wei) 例)

反應結束後,qPCR儀(yi) 將自動生成結果。若儀(yi) 器自動生成的擴增曲線或閾值線有異常,用戶可根據實際情況自行調整,基線Start值可以在 3~10,基線End值可設在 5~20,調整各擴增曲線的基線區相對水平即可。點擊Analyze 進行分析。

5、質量控製

試劑盒中各控製項應符合下列要求,否則實驗無效。


陽性對照

陰性對照

FAM通道GaPV

Ct32

Ct值或Ct>40

VIC通道

(內(nei) 標)

Ct值或Ct>40

典型的S形曲線,Ct35

參考qPCR工作液配製表(其它方式)配製時,陽性對照的VIC通道應出現S型曲線,Ct35

檢驗結果的解釋

(1)若樣品的VIC通道呈典型的S形曲線且Ct35時,

A. FAM通道Ct35,判定為(wei) GaPV陽性

B. FAM通道Ct值在3540之間時,需要觀察靶基因的擴增曲線是否呈S形,如果曲線呈S形,樣品應視為(wei) 疑似GaPV陽性,需重新檢測;複測結果若Ct值≦40且具有典型S形曲線,判定為(wei) GaPV陽性;反之若為(wei) 無Ct顯示Ct>40或無典型S形曲線,則判定為(wei) GaPV陰性。

C. FAM通道Ct>40,判定為(wei) GaPV陰性

2)如果VIC通道的Ct值高於(yu) 35,而沒有顯示明顯的S形擴增曲線,原因如下:

1) 樣品中存在PCR抑製劑,建議實驗前稀釋模板

2) 核酸提取操作存在缺陷,建議重複核酸提取進行檢測

3) 在處理過程中沒有獲得合格的樣品,或者在運輸和儲(chu) 存過程中樣品已經降解,建議重新采樣。

檢驗方法的局限性

1) 陰性結果可能是由於(yu) 從(cong) 樣品中提取的核酸質量低,儲(chu) 存條件不當,儲(chu) 存期不合適,樣品中存在抑製劑,核酸降解和核酸提取方法的提取效率差等原因。

2) 不合理的樣品采集、運送與(yu) 保存條件,樣品中病毒含量過低,或不合理的實驗操作和環境很可能造成假陰性或假陽性結果。其它臨(lin) 床觀察和相關(guan) 資料應結合測定,必要時再次進行檢測。

3) 由於(yu) 突變或其它原因,靶序列的序列變化可能會(hui) 產(chan) 生假陰性結果。

注意事項:

1) 本產(chan) 品僅(jin) 用於(yu) 科研使用,使用前請仔細閱讀本說明書(shu) 。

2) 實驗前請熟悉和掌握需使用的各種儀(yi) 器的操作方法和注意事項,對每次實驗進行質量控製。

3) 實驗室管理需嚴(yan) 格遵照PCR基因擴增實驗室的管理規範,實驗人員必須進行專(zhuan) 業(ye) 培訓,實驗過程嚴(yan) 格分區進行, 所有消耗品僅(jin) 作一次性使用,實驗操作的每個(ge) 階段使用專(zhuan) 用儀(yi) 器和設備,各區各階段用品不可交叉使用。

4) 所有檢測樣品均視為(wei) 具有傳(chuan) 染性的物質,實驗過程中穿工作服並經常更換手套,以避免樣品間的交叉汙染;

5) 樣品操作、廢棄物處理應符合相關(guan) 法規要求:《微生物生物醫學實驗室生物安全通用準則》和《醫療廢物管理 條例》。

6) 所有試劑 (包括本產(chan) 品中的組分與(yu) 客戶自備試劑) 使用前均需徹底化凍、混勻。

7) 液類樣品溶血嚴(yan) 重時,會(hui) 使擴增曲線高度顯著下降。因此,當使用該試劑盒同時檢測血樣品原液和生理鹽水稀釋 樣品時,建議對2類模板分別設置不同的閾值線,以保證結果的準確性。

8) 當出現多個(ge) 樣品的Ct>40時,可能是qPCR儀(yi) 自動生成的閾值線較高的原因,建議將閾值線高度設置在擴增曲線 最大熒光值的1/15左右後,重新分析。

本產(chan) 品僅(jin) 供科研使用,檢測結果不能用作臨(lin) 床診斷判斷唯一依據

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