羊痘病毒(GaPV)核酸檢測試劑(熒光PCR法,外源內(nei) 標)
包裝規格:48 T/盒
產(chan) 品說明:
采用Taqman探針技術,以羊痘病毒(GaPV,羊痘病毒屬包含綿羊痘病毒、山羊痘病毒和牛結節性皮膚病病毒等3種病毒)的特異性保守基因為(wei) 靶位點設計特異性引物和探針,用於(yu) 樣品中GaPV核酸的輔助檢測。本產(chan) 品引入了dUTP / UDG 係統,可降解含U的ssDNA和dsDNA,消除由PCR產(chan) 物導致的交叉汙染。 同時設置陽性內(nei) 對照 (即內(nei) 標,使用VIC報告基團),通過檢測內(nei) 標是否正常來監測qPCR體(ti) 係中是否含有 PCR抑製物,避免出現假陰性結果。
產(chan) 品組成:
組分名稱 | 主要成分 | DV231Y-21-V1 | |
1 | GaPV PreMix-2 | qPCR反應緩衝(chong) 液、dNTPs、UDG酶、Taq酶、引物、探針等 | 960 μL/管 |
2 | GaPV陰性對照-2 | 無酶水 | 400 μL/管 |
3 | GaPV內(nei) 標對照-2 | 含內(nei) 標擴增片段的核酸 | 480 μL/管 |
4 | GaPV陽性對照-2 | 含目標擴增片段的核酸 | 50 μL/管 |
注:不同批號產(chan) 品的成分之間不可以混用或互換!!!
儲(chu) 存條件和保質期:
在-20±5℃避光儲(chu) 存,有效期12月。幹冰運輸。重複凍融小於(yu) 5次。生產(chan) 日期,失效日期請見外包裝盒。
適用儀(yi) 器:
ABI7500、宏石96P、Bio-Rad CFX96實時熒光PCR儀(yi) 等。
樣品要求:
1、適用樣品類型
活體(ti) 或剖檢牛羊的皮膚丘疹、肺部病變組織、淋巴結、血液等樣品。
要求送檢新鮮樣品,禁止反複凍融!
2、樣品處理(核酸提取區)
參照《NY/T 541-2016 獸(shou) 醫診斷樣品采集、保存與(yu) 運輸技術規範》等標準進行樣品前處理, 使用商業(ye) 化的提取試劑盒提取樣品中的核酸。提取時,每200 μL陰性對照和處理後的樣品溶液中添加10 μL內(nei) 標對照,提取後的核酸應立即檢測,否則凍存於(yu) -20±5℃,保存時間不超過6個(ge) 月,禁止反複凍融!
*內(nei) 標對照的其它使用方法:將內(nei) 標對照混入 qPCR工作液中,但僅(jin) 僅(jin) 質控擴增過程和監測qPCR體(ti) 係中是否含有 PCR抑製物,不能質控提取核酸過程。
檢測方法
為(wei) 了防止汙染,實驗需分區操作!!!
注:核酸提取參照樣品要求,在核酸提取區進行或在樣品處理區進行。
1、試劑準備 (在試劑準備區進行)
(1) 推薦方式(內(nei) 標對照質控核酸提取和核酸擴增過程)
取出試劑盒中的各組分以及自備試劑,室溫放置,待溫度平衡至室溫,混勻後備用;
根據檢測樣品數量,建議每次檢測均設置陰性對照和陽性對照。將所需數量(N)的GaPV PreMix-2分配到每個(ge) 微離心管(如八連管)中,20 μL/管。待檢樣品數為(wei) n時,所需反應數N=樣品數(n)+陽性對照(1)+陰性對照(1);
當準備使用時,再轉移到樣品處理區。
(2) 其它方式(內(nei) 標對照僅(jin) 質控核酸擴增過程)
根據所檢測的樣品數量按照下表配製反應液,建議每次檢測均設置陰性對照和陽性對照。待檢樣品數為(wei) n時, 需配製反應體(ti) 係數N=待檢樣品數(n) +陽性對照(1)+陰性對照(1)+1。
*qPCR工作液配製表(其它方式)
組份 | 每反應體(ti) 積(μL) |
GaPV PreMix-2 | 20 μL×N |
GaPV內(nei) 標對照-2 | 0.5 μL×N |
*注:本配製方法為(wei) 在提取樣品核酸未加內(nei) 標對照時的補救方法,不推薦。
將配製好的qPCR工作液充分混勻後瞬時離心,待用;當準備使用時,將等量的20 μL分配到每個(ge) 微離心管(如八連管)中,並轉移到樣品處理區。
2、樣品加樣 (在樣品處理區進行)
在每個(ge) PCR管中加入5 μL經提取的待測樣品和陰性對照、陽性對照,蓋上管蓋, 瞬時離心,使液體(ti) 全部沉於(yu) 管底。
3、qPCR擴增 (在擴增與(yu) 分析區進行)
(1) 熒光通道選擇
熒光基團選擇FAM通道檢測GaPV;選擇VIC 通道檢測內(nei) 標;淬滅基團設置為(wei) none。如ABI qPCR儀(yi) ,還需設置Passive Reference為(wei) none。其它儀(yi) 器參考儀(yi) 器說明書(shu) 。
(2) qPCR擴增程序設置
設置反應體(ti) 係為(wei) 25 μL。
步驟 | 溫度 | 反應時間 | 循環 | |
UDG消化 | 50℃ | 5 min | 1 | |
預變性 | 95℃ | 30 sec | 1 | |
擴增 | 變性 | 95℃ | 5 sec | 45 |
退火與(yu) 延伸 | 60℃ | 35 sec,數據收集 |
4、結果分析 (以ABI7500 qPCR儀(yi) 為(wei) 例)
反應結束後,qPCR儀(yi) 將自動生成結果。若儀(yi) 器自動生成的擴增曲線或閾值線有異常,用戶可根據實際情況自行調整,基線Start值可以在 3~10,基線End值可設在 5~20,調整各擴增曲線的基線區相對水平即可。點擊Analyze 進行分析。
5、質量控製
試劑盒中各控製項應符合下列要求,否則實驗無效。
陽性對照 | 陰性對照 | |
FAM通道(GaPV) | Ct≦32 | 無Ct值或Ct>40 |
VIC通道 (內(nei) 標) | 無Ct值或Ct>40 | 典型的S形曲線,Ct≦35 |
參考qPCR工作液配製表(其它方式)配製時,陽性對照的VIC通道應均出現S型曲線,Ct值≦35。
檢驗結果的解釋
(1)若樣品的VIC通道呈典型的S形曲線且Ct≦35時,
A. 當FAM通道Ct≦35,判定為(wei) GaPV陽性;
B. 當FAM通道Ct值在35到40之間時,需要觀察靶基因的擴增曲線是否呈S形,如果曲線呈S形,樣品應視為(wei) 疑似GaPV陽性,需重新檢測;複測結果若Ct值≦40且具有典型S形曲線,判定為(wei) GaPV陽性;反之若為(wei) 無Ct顯示、Ct>40或無典型S形曲線,則判定為(wei) GaPV陰性。
C. 當FAM通道Ct>40,判定為(wei) GaPV陰性。
(2)如果VIC通道的Ct值高於(yu) 35,而沒有顯示明顯的S形擴增曲線,原因如下:
1) 樣品中存在PCR抑製劑,建議實驗前稀釋模板。
2) 核酸提取操作存在缺陷,建議重複核酸提取進行檢測。
3) 在處理過程中沒有獲得合格的樣品,或者在運輸和儲(chu) 存過程中樣品已經降解,建議重新采樣。
檢驗方法的局限性
1) 陰性結果可能是由於(yu) 從(cong) 樣品中提取的核酸質量低,儲(chu) 存條件不當,儲(chu) 存期不合適,樣品中存在抑製劑,核酸降解和核酸提取方法的提取效率差等原因。
2) 不合理的樣品采集、運送與(yu) 保存條件,樣品中病毒含量過低,或不合理的實驗操作和環境很可能造成假陰性或假陽性結果。其它臨(lin) 床觀察和相關(guan) 資料應結合測定,必要時再次進行檢測。
3) 由於(yu) 突變或其它原因,靶序列的序列變化可能會(hui) 產(chan) 生假陰性結果。
注意事項:
1) 本產(chan) 品僅(jin) 用於(yu) 科研使用,使用前請仔細閱讀本說明書(shu) 。
2) 實驗前請熟悉和掌握需使用的各種儀(yi) 器的操作方法和注意事項,對每次實驗進行質量控製。
3) 實驗室管理需嚴(yan) 格遵照PCR基因擴增實驗室的管理規範,實驗人員必須進行專(zhuan) 業(ye) 培訓,實驗過程嚴(yan) 格分區進行, 所有消耗品僅(jin) 作一次性使用,實驗操作的每個(ge) 階段使用專(zhuan) 用儀(yi) 器和設備,各區各階段用品不可交叉使用。
4) 所有檢測樣品均視為(wei) 具有傳(chuan) 染性的物質,實驗過程中穿工作服並經常更換手套,以避免樣品間的交叉汙染;
5) 樣品操作、廢棄物處理應符合相關(guan) 法規要求:《微生物生物醫學實驗室生物安全通用準則》和《醫療廢物管理 條例》。
6) 所有試劑 (包括本產(chan) 品中的組分與(yu) 客戶自備試劑) 使用前均需徹底化凍、混勻。
7) 血液類樣品溶血嚴(yan) 重時,會(hui) 使擴增曲線高度顯著下降。因此,當使用該試劑盒同時檢測血液樣品原液和生理鹽水稀釋 樣品時,建議對2類模板分別設置不同的閾值線,以保證結果的準確性。
8) 當出現多個(ge) 樣品的Ct值>40時,可能是qPCR儀(yi) 自動生成的閾值線較高的原因,建議將閾值線高度設置在擴增曲線 最大熒光值的1/15左右後,重新分析。
本產(chan) 品僅(jin) 供科研使用,檢測結果不能用作臨(lin) 床診斷判斷唯一依據
從(cong) 2011年開始我們(men) 致力於(yu) 在生命科學領域、生物醫學實驗技術及論文潤色服務,協助客戶各類實驗服務及論文潤色十多年,是您值得信賴的科研合作夥(huo) 伴!
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